中科院1区|IF6.7:基于PCA/OPLS-DA和KEGG通路分析的多组学整合,揭示沙棘-水飞蓟复方改善高脂血症的分子基础
中科院1区|IF6.7:基于PCA/OPLS-DA和KEGG通路分析的多组学整合,揭示沙棘-水飞蓟复方改善高脂血症的分子基础
在当下科研领域,多组学技术与天然产物研究的交叉融合正成为炙手可热的趋势。从人工智能赋能精准医疗,到量子计算助力复杂生物模型解析,前沿科技不断重塑着我们对生命科学的认知边界。在此大环境下,天然产物凭借其丰富的生物活性与低毒副作用等特性,愈发受到科研界青睐,探寻其作用机制、挖掘潜在应用价值的研究呈井喷之势。在众多研究手段中,整合多组学数据,全方位剖析天然产物功效的研究思路脱颖而出,为科研人员解锁了新的探索路径。而接下来要介绍的这篇论文,便是在此浪潮下,巧妙运用生物信息方法及其他技术,深度挖掘沙棘-水飞蓟固体饮料降脂奥秘的佳作。
https://doi.org/10.1016/j.phymed.2025.156920
正式介绍
基本信息
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论文标题:多组学分析揭示沙棘-水飞蓟固体饮料对高脂血症大鼠的降脂作用
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发表期刊:Phytomedicine,中科院医学大类分区1区,IF=6.7000
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发表日期:2025年8月1日在线发表
研究背景
高脂血症是心血管疾病的重要危险因素,而天然植物来源的功能食品因安全性高、多靶点作用等优势,成为降脂药物的潜在替代方案。沙棘(Hippophae rhamnoides L.)和水飞蓟(Silybum marianum (L.) Gaertn.)分别具有降脂和保肝活性,但其复方固体饮料的作用机制尚不明确。
研究思路
模型构建:高脂饮食诱导SD大鼠高脂血症模型,设置沙棘-水飞蓟固体饮料低、中、高剂量组及阳性药对照组;多组学分析:采用UPLC-QTOF-MS/MS鉴定固体饮料成分,结合血浆/肝脏代谢组学、脂质组学及肝脏转录组学分析差异分子;机制验证:通过RT-qPCR和Western blot验证脂质代谢相关基因(如Cpt1α、SCD)的表达变化。
研究亮点
首次结合多组学技术:系统解析沙棘-水飞蓟复方的降脂机制,发现其通过调节胆固醇合成、脂肪酸β-氧化及脂质代谢通路发挥作用;成分-功效关联分析:鉴定出89种活性成分(以黄酮类为主),并通过代谢通路富集揭示其协同作用模式;剂量效应关系明确:中剂量(0.15 g/kg/d)即可显著改善血脂指标,效果与阳性药相当。
数据来源和生物信息方法
1、数据来源
大鼠血清、肝脏组织(n=10/组)的代谢物、脂质及转录本数据。
2、生物信息方法
代谢组学/脂质组学:PCA、OPLS-DA分析差异代谢物,MetaboAnalyst进行通路富集;转录组学:DESeq2筛选差异基因(FDR≤0.05,|FC|≥1.5),GO/KEGG功能注释;多组学整合:通过KEGG通路交叉分析,构建“代谢物-基因”调控网络。
主要结果
1、固体饮料成分分析
通过UPLC-QTOF-MS/MS鉴定出89种成分,主要为黄酮类(如槲皮素、芦丁)、酚酸类及脂肪酸,其中黄酮类含量≥1240 mg/g。小结:丰富的黄酮类成分可能是其降脂活性的物质基础。
图1|H-S固体饮料在正离子(A)和负离子(B)模式下的总离子流色谱图
2、降脂与保肝效果(图2-5)
体重与器官指数:中、高剂量组显著降低体重、肝脏指数及脂肪组织重量(图2C-J,图3);血清与肝脏生化指标:显著降低TC、TG、LDL-C水平,升高HDL-C,同时降低AST、ALT及MDA,升高SOD、GSH-Px(图5);组织病理:HE和油红O染色显示肝脏脂肪空泡减少,脂肪细胞肥大减轻(图4)。小结:沙棘-水飞蓟固体饮料可有效改善高脂饮食诱导的脂质蓄积和肝损伤。
图2|H-S固体饮料对高脂血症大鼠肥胖特征指标的影响(n=10)
3、代谢组学与脂质组学分析(图6-11)
差异代谢物:血浆和肝脏中鉴定出31种和22种差异代谢物,涉及甘油磷脂代谢、不饱和脂肪酸合成等通路(图7E-F);脂质变化:肝脏中磷脂(PE、PC)、甘油三酯(TG)、胆固醇酯(CE)水平显著降低,而溶血磷脂(LPC)、神经酰胺(Cer)升高(图10-11)。小结:固体饮料通过调节磷脂代谢和脂肪酸氧化改善脂质紊乱。
图6|血浆(A)和肝脏(B)的PCA得分图;血浆(C)和肝脏(D)的OPLS-DA得分图;血浆(E)和肝脏(F)的置换检验图(n=6)
图7|血浆(A-B)和肝脏(C-D)差异代谢物热图(红色表示高表达,绿色表示低表达);血浆(E)和肝脏(F)潜在生物标志物的通路富集分析
4、转录组学分析(图12-14)差异基因
高脂模型组与正常组相比有325个差异基因,固体饮料处理后逆转266个,涉及PPAR信号、脂肪酸β-氧化等通路(图12F);关键基因验证:RT-qPCR和Western blot显示,Cpt1α、PPARα表达上调,SCD、ANGPTL4表达下调(图14B-K)。小结:转录水平上证实固体饮料通过激活脂肪酸氧化、抑制胆固醇合成和脂肪生成发挥作用。
图14|脂质代谢的多组学整合分析
研究结论
沙棘-水飞蓟固体饮料通过调节肝脏胆固醇合成(Pdk4、HMGCS1、DHCR24)、脂肪生成(SCD、ANGPTL4)及脂肪酸β-氧化(Cpt1α、PPARδ)相关基因表达,协同改善高脂血症大鼠的脂质代谢紊乱,为天然功能食品开发提供了新的理论依据。
研究的局限性和未来方向
局限性:未探究肠道菌群在降脂中的作用,且长期安全性数据不足。
未来方向:结合宏基因组学解析肠道菌群介导的机制,开展人体临床试验验证功效,开发靶向脂质代谢的复方制剂。
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