R 安装和查看历史版本 R 包指南

一、查看 R 包的可用版本

方法 1：通过 CRAN Archive 查看历史版本

你可以通过以下网址格式查看某个 R 包在 CRAN 上的所有历史版本：

https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/<包名>/

例如查看 Seurat 包的历史版本：

https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Seurat/

页面会列出所有旧版本源码包（.tar.gz）。

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方法 2：R 中查看可用版本（有限）

虽然不能列出全部历史版本，但可以检查当前已安装包是否为旧版本：

old.packages()

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二、安装指定版本的 R 包

方法 1：使用 remotes::install_version() 安装 CRAN 上的历史版本

推荐使用 remotes 包来安装指定版本：

1. 安装 remotes 包（若尚未安装）：

install.packages("remotes")

2. 安装指定版本，例如安装 Seurat 的 4.3.0 版本：

remotes::install_version("Seurat", version = "4.3.0")

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方法 2：手动下载 .tar.gz 并安装

1. 前往 CRAN Archive 下载所需版本源码压缩包。
2. 使用以下命令安装：

install.packages("/path/to/Seurat_4.3.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")

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方法 3：从 GitHub 安装指定版本或历史 commit

适用于 GitHub 上开发的 R 包：

• 按标签版本号安装：

remotes::install_github("satijalab/seurat@v4.3.0")

• 或根据 commit hash 安装：

remotes::install_github("satijalab/seurat@commit_hash")

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三、其他实用方式

使用 checkpoint 包还原某个日期的包快照

install.packages("checkpoint")
library(checkpoint)

checkpoint("2023-08-01")  # 加载 2023 年 8 月 1 日的包环境快照

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四、补充建议

• 使用 renv 或 packrat：推荐使用这类依赖管理工具自动记录并还原项目使用的包版本。
• 安装 Bioconductor 包的指定版本：

BiocManager::install("包名", version = "3.17")

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