【科研绘图系列】R语言绘制散点图(scatter plot)
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文章目录
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- 介绍
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- 数据准备
- 图表绘制
- 图表组合
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 画图
- 画图
- 总结
- 系统信息
介绍
这段代码是一个基于R语言的数据处理和可视化脚本,主要使用了dplyr和ggplot2包来分析和绘制微生物数据。数据包括MRO(Mean contributions)和MIP(Mean interactions)变量的平均值,以及相关的分类变量,如样本(sample)、交互类型(intertype)和门(phyla)。以下是详细的介绍:
数据准备
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数据读取:
- 从文件
site_bin_mro_mip_var中读取数据,存储在变量del_var中。 - 从文件
../fig.2/site.rand_mro_mip_div中读取数据,存储在变量pri_data中,并将行名(sample)添加为一列。 - 从文件
3867pop.phyla中读取数据,存储在变量pop_phyla中,并设置列名为bin和phyla。
- 从文件
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数据合并:
- 使用
left_join函数将del_var和pri_data按sample列合并,再将结果与
- 使用
