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【科研绘图系列】R语言绘制散点图(scatter plot)

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文章目录

    • 介绍
      • 数据准备
      • 图表绘制
      • 图表组合
    • 加载R包
    • 数据下载
    • 导入数据
    • 数据预处理
    • 画图
    • 画图
    • 总结
    • 系统信息

介绍

这段代码是一个基于R语言的数据处理和可视化脚本,主要使用了dplyrggplot2包来分析和绘制微生物数据。数据包括MRO(Mean contributions)和MIP(Mean interactions)变量的平均值,以及相关的分类变量,如样本(sample)、交互类型(intertype)和门(phyla)。以下是详细的介绍:

数据准备

  • 数据读取

    • 从文件site_bin_mro_mip_var中读取数据,存储在变量del_var中。
    • 从文件../fig.2/site.rand_mro_mip_div中读取数据,存储在变量pri_data中,并将行名(sample)添加为一列。
    • 从文件3867pop.phyla中读取数据,存储在变量pop_phyla中,并设置列名为binphyla
  • 数据合并

    • 使用left_join函数将del_varpri_datasample列合并,再将结果与
http://www.dtcms.com/a/577449.html

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