pKa预测模型——pKa-predictor

MoitessierLab/pKa-predictorhttps://github.com/MoitessierLab/pKa-predictor1、前言

        这个安装非常简单。直接把环境中所需要的包安装好，就可以直接输入代码使用了。点赞！尝试了好多pKa预测的模型，有的github代码根本就不完整，导致部署一般无法运行。

2、部署方法（linux环境）

2.1 下载包并且解压

2.2 配置好包

pip install torch torch_geometric pandas numpy rdkit seaborn hyperopt

2.3 进入GNN文件夹，运行程序

python main.py --mode infer --data_path ..\Datasets\ --input your_input.csv --infer_pickled ..\Datasets\pickled_data\infer_pickled.pkl --model_dir ..\Model\ > infer_your_input.out

-input your_input.csv

这里输入你的文件地址，注意，需要有一列列名为：Smiles,其他随意（Smiles一定要大写！）

结果会输出到GNN文件夹中的infer_your_input.out当中