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哪些仪器适合对接电子实验记录本,哪些不适合?

在现代实验室中,将仪器与电子实验记录本(ELN)进行对接,能够极大地提升实验数据管理的效率与准确性。然而,并非所有仪器都适合与ELN对接,这需要综合多方面因素来考量。

以电子天平为例,如果每天需要高频称量几百次,对接ELN能显著提高数据记录效率,减少人工记录误差;但如果只是偶尔且独立地称量,对接的必要性就较低。那么在其他仪器领域,情况又是怎样的呢?

从产生数据的格式来看,实验室仪器分为2种类型

(1)简单读值型,通常实时产生单一样品、单一类型的短数值(有效数字通常小于5位),不生成文件,如天平、pH计、发酵罐DO传感器等,它们如果记录频率低,并不适合与ELN对接。

(2)能自动生成报告或原始数据文件的设备,通常产生高涵量数据(eg. 图谱、大批样品数值),如HPLC、LC-MS、NMR、XRD、其他色谱仪、光谱仪、酶标仪、电化学分析仪、流式细胞仪、PCR仪、测序仪、显微镜等。这些稳定导出PDF/CSV/图像等文件的仪器,相对更适合对接ELN。

下面以HPLC为例对第二类仪器的对接展开讨论。

1,HPLC适合文件层级的对接

HPLC(高效液相色谱仪)在实验中会产生高涵量数据文件。在文件层级对接时,这些数据文件须另存为PDF文件,并在文件名中人工加入ELN的实验页码,然后通过一定路径,传送到“仪器数据中心”。之后,ELN能够自动凭借页码从该中心抓取并汇总这些文件。这种文件层级的对接,操作相对简便,成本较低,对于大多数企业而言,实现这一层级的对接,就足以满足数据管理的基本需求,达到数据管理的核心价值。例如,某药企研发实验室,通过这种文件层级的对接方式,成功实现了HPLC数据在ELN中的集中管理与快速检索,避免了使用U盘人工拷贝,还节省了每个月几小时由人工备份数据的时间,极大提高了实验数据的利用效率和安全可及,在NMPA和FDA检查中满分过关。

2,ELN可实现文件层级的数据解析

ELN具备强大的数据解析能力,对于HPLC生成的PDF文件中的多种参数、数值,它能够通过OCR表格数据识别技术,将相关数据准确提取出来,然后手动选择目标位置,将数据复制到ELN中。这一过程使得数据从仪器文件中脱离出来,以结构化的形式整合到ELN里,方便后续的查询、分析与统计。比如,在对一系列药品成分分析的实验中,ELN通过数据解析,快速整理HPLC检测出的各成分AUC含量数据,粘贴到人工选择合适的实验记录位置,为实验人员进一步分析药品质量提供了便利。

3,ELN可实现数值对接

ELN在数值对接方面展现出了高效且精准的优势——首先要在ELN表格里写上待填充的数据格式,然后对HPLC生成PDF文件中的表格AUC数据进行自动提取,最后按配好的数据格式直接将数据导入到这个表格中(ELN表格、PDF AUC表格之间的字段内容会自动匹配)。经过这三步,实验数据能够快速无误地进入ELN的管理体系。某化工企业在进行产品纯度检测实验时,运用数值对接功能,让HPLC数据(峰面积、峰高、保留时间、条件等)准确导入ELN表格,为生产工艺的优化提供了前所未有的数据支持。

4,API级数据对接

API级数据对接是一种更为高级的对接方式。以色谱系统为例,通过API进行数据对接,能够实现数据的实时、自动传输。然而,这种对接方式代价高昂。国外的色谱系统虽然拥有较为完善的API,但收费往往与一台色谱硬件系统价格相近;而国内的色谱仪器API常常存在不完善、版本变化大等问题,导致对接时工作量巨大,成本同样居高不下。

并且,API对接方式更适合LIMS(实验室信息管理系统)这种流程和数据位置非常固化的系统。LIMS基于由样品ID和检测项为主字段构成的数据表,能够精准查找数据存放位置并实现数据插入。

相比之下,由于ELN是用于灵活记录实验内容的系统,一般不以样品ID及检测项为主字段,无法像LIMS锁定色谱数据的指定位置,因此难以实现基于接口的对接。

总结

这四种对接方式的成本是逐层上升的。95%公司适合第一种文件层级的对接,能够实现数据管理就已足够。要求较高的公司可以考虑第二、第三种对接方式,但成本和难度会相应增高。其余不到1%有专门要求且预算非常充沛的公司,才会考虑第四种API级对接,但实际上此时已不适合对接ELN,而是更适合对接LIMS。在选择仪器与ELN的对接方式时,各实验室应综合自身需求、成本预算等多方面因素,做出最为合适的决策。

参考资料

1. 天平值不值得和电子实验记录本ELN做对接?

https://zhuanlan.zhihu.com/p/1934653799009584697

图片

PhDTool,2025年8月

http://www.dtcms.com/a/339480.html

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