TIMER免疫浸润分析

TIMER则提供6种免疫细胞（B cells, CD4+ T cells, CD8+ T cells, Neutrphils, Macrophages and Dendritic cells ）的浸润情况。

TIMER分析

包括基因、生存、基因突变、体细胞拷贝数变异与免疫浸润的关系，多癌种的肿瘤和正常组织的差异表达，两个基因的相关性，以及上传自己的数据进行分析。

生存分析

可以选择不同年龄、性别、种族等。

相关性分析

主要展示基因的共表达关系，可以矫正肿瘤纯度或年龄。右上角和左下角的图表示年龄（或肿瘤纯度）与基因表达的关系，右下角则表示两个基因间的共表达关系。

TIMER2.0

TIMER2.0于2020年发布，包含三大模块

一、Immune Association

免疫相关包含基因（Gene）、突变（Mutation）、体细胞拷贝数变异（sCNA）和结局（Outcome）四个项目。

二、Cancer Exploration

癌症探索包含差异基因（Gene_DE）、结局（Gene_Outcome）、突变（Gene_Mutation）和相关性（Gene_Corr）四个项目。

三、Immune Estimation

上传自己的数据进行分析

肿瘤免疫细胞浸润成为热点，TIMER数据库来练手-生信自学网

TIMER

TIMER2.0

肿瘤免疫火得飞起，更新后的TIMER 2.0数据库真心好用！ - 知乎