每周靶点分享:Nectin-4、CDH6及文献分享
本期精选了《ADC赛道新型靶点Nectin-4》《钙粘蛋白CDH6》《文献分享:基于计算机和体外工具优化开发治疗性抗体》《文献分享:Kabat、Chothia、AbM和IMGT抗体编号方案的差异评估》四篇文章。以下为各研究内容的概述:
ADC赛道新型靶点Nectin-4
细胞粘附蛋白4(Nectin-4),也称为脊髓灰质炎病毒受体相关蛋白4。Nectin-4还与肿瘤生长、血管生成、转移和复发密切相关。由于Nectin-4靶点特异性表达,Nectin-4已成为一种潜在的生物标志物和有希望的癌症治疗靶点。
钙粘蛋白CDH6
CDH6也称为胎儿肾钙粘蛋白或K-钙粘蛋白,参与胚胎肾脏的形态发生和发育,驱动肾脏形态发生所必需的间充质-上皮分化。它在靶向治疗卵巢癌种发挥重要作用。
文献分享:基于计算机和体外工具优化开发治疗性抗体
严格评估抗体的可开发性对于在进入临床研究之前优化候选药物至关重要。最近在预测蛋白质结构、表面特性、稳定性和免疫原性的工具方面取得了进展,这使得新生物制剂的开发变得更加顺畅。然而,由于互补决定区(CDRs)的多样性,特别是CDR3s,准确预测单个氨基酸置换对抗体结构的影响仍然具有挑战性。
2024年12月20日,研究人员在Antibodies(Basel)上发表了一篇名为“Integrating In Silico and In Vitro Tools for Optimized Antibody Development—Design of Therapeutic Anti-oxMIF Antibodies”的文章,该研究结合了计算机模拟工具和体外评估,以针对氧化型巨噬细胞迁移抑制因子(oxMIF)改进抗体,基于第一代抗oxMIF抗体imalumab。通过在可变区域引入突变,候选抗体C0083由于其重链CDR3环的重构而显示出降低的疏水性和自相互作用,尽管这些结构变化,C0083仍保留了对靶标的特异性和对oxMIF的结合亲和力。证明少量精心选择的突变足以显著提高抗体的性能。
文献分享:Kabat、Chothia、AbM和IMGT抗体编号方案的差异评估
抗体的互补决定区(CDR)是抗体序列和结构特征最多样化的区域,在抗体识别和结合免疫应答中发挥着最关键的作用。在过去的几十年里,已经引入了几种基于序列的编码方案,如Kabat、Chothia、AbM和IMGT等。然而,多种编码方案的存在导致了潜在的混淆,并且缺乏对这些方案的全面评估。
2024年12月4日,Antibodies(Basel)上发表了一篇名为“50 Years of Antibody Numbering Schemes: A Statistical and Structural Evaluation Reveals Key Differences and Limitations”的文章,该研究采用了统计分析来量化CDR编号方案的多样性差异。该研究揭示了抗体序列数据库中的区域序列和结构保守性,同时也凸显了不同编号方案引起的差异。这些见解为精确描述抗体CDR和抗体库的策略设计提供了有价值的指南,并对开发基于抗体的创新疗法和诊断具有实际意义。
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