脑影像分析软件推荐| SimTB
目录
1. 软件界面
2.工具包功能简介
3.软件安装注意事项
1. 软件界面
2.工具包功能简介
SimTB 是一个 Matlab 工具箱，允许在时空可分离性模型下灵活生成 fMRI 数据集，旨在促进各种分析方法的测试。用户可以完全控制生成的数据集，包括创建和操作空间源、实施与块和事件相关的实验设计、包含组织特异性基线、模拟头部运动等。MATLAB 入门用户可以使用 SimTB GUI和脚本来生成模拟数据。
GUI基本操作：
1、在命令行输入sumtb
2、Initialize：参数设置
a）设置输出文件夹前缀，多个模拟数据能够在有相同前缀的输出文件夹中储存；设置文件格式（.mat或.nii）
b）设置模拟数据维度：被试数目、成分数量、时间点数量、TR等
3、设置成分空间成分：设置不同空间成分对应的标签、空间成分的个数，每个空间成分是否在每个被试中出现（component presence/absence），以及其位移（x or y-translation）、放缩（rotation）度数
4、时间进程设置
5、噪声设置：添加随机噪声和头动噪声
6、可视化
3.软件安装注意事项
需要将SimTB和其子文件夹添加到Matlab路径中，后在命令行输入simtb
参考文献：
Erhardt, E. B., Allen, E. A., Wei, Y., Eichele, T., & Calhoun, V. D. (2012). SimTB, a simulation toolbox for fMRI data under a model of spatiotemporal separability. Neuroimage, 59(4), 4160-4167.