centos8-安装R+ggplot2
问题描述
在使用蛋白质可溶性预测工具时,发现绘图部分使用的是R,并且用到了ggplot2包,需要安装。
解决方案
安装R的命令是:
sudo yum install R -y
如果提示找不到可以匹配的R的版本,可以启用powertools(默认是不开启的)。使用下面两条命令,然后再安装R:
dnf install 'dnf-command(config-manager)' -y
sudo yum config-manager --set-enabled powertools
解释:
- dnf: DNF(Dandified Yum)是一个包管理工具,用于在基于RPM的Linux发行版中安装、更新、删除和管理软件包。
- dnf-command(config-manager) 是一个包含 config-manager 命令的软件包,该命令用于管理DNF的仓库配置。
-y
表示在安装过程中自动回答“yes”以避免用户需要手动确认安装- yum: YUM(Yellowdog Updater, Modified)是一个包管理工具,类似于DNF,用于在基于RPM的Linux发行版中管理软件包。在较新的系统中,yum 通常是指向 dnf 的符号链接
--set-enabled powertools
用于启用名为 powertools 的仓库。powertools 是一个包含额外工具和软件的仓库,通常用于CentOS或RHEL系统。
安装完之后可以检查一下R的版本:
(base) [root@localhost protein-sol]# R --version
R version 4.4.3 (2025-02-28) -- "Trophy Case"
Copyright (C) 2025 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under the terms of the
GNU General Public License versions 2 or 3.
For more information about these matters see
https://www.gnu.org/licenses/.
启动R:
R
启动后安装ggplot2:
install.packages("ggplot2")