如何利用R语言 进行生物多样性测定、生物量模型构建、生物完整性指数(IBI)筛选与生态环境状况综合指数(EI)计算

利用Rstudio、Fragstats等软件分析计算生态环评中所需各种指数，利用ENVI、Maxent等软件分析制作生态环评中所需各种图件。内容包括生态环评的工作程序、生物多样性测定、生物量及净初级生产力测定、生态系统格局及服务功能评估、生物完整性指数测定、景观指数计算、生态环境状况综合指数计算；土地利用现状图的制作、植被类型图的制作、植被覆盖度图的制作、生态系统类型图的制作、物种适宜生境分布图的制作等

【内容简介】：

专题一 生态环境影响评价框架及流程

以某既包含陆域、又包含水域的项目为主要案例，兼顾其它类型项目，主要内容包括：
1、生态环境影响评价基本思路与要求：工作程序、报告编制技术要求与规范
2、资料收集与初步踏勘：工程技术文件及生态环境基础资料
3、评价等级及评价范围确定：生态保护目标、工程占地规模
4、评价因子和生态保护目标确定：物种、生境、生物群落、生态系统、生物多样性、生态敏感区、自然景观等不同受影响对象所对应的评价因子
5、生态现状调查与评价：陆生生态、水生生态、主要生态问题、一、二级评价主要工作内容
6、生态影响预测与评价：不同类型项目评价重点(矿产资源开发项目、水利水电项目、公路铁路管线等线性工程项目、农业林业渔业等建设项目)
7、生态保护对策措施：不同类型项目生态保护措施的共性与差别
8、生态影响评价结论、生态影响评价自查表

专题二、基于遥感解译的土地利用现状图的编制

1、土地利用分类体系
2、ENVI绘制土地利用现状图
1）影像下载：常用遥感影像数据库
2）图像校正：辐射定标、大气校正
3）影像裁剪：规则、不规则、矢量
4）非监督分类：ISODATA、K-Means
5）监督分类：最大似然法、最小距离法
6）分类后处理：过滤分析、Majority/Minority分析、分类统计
7）图件制作：ENVI Classic制图、自定义制图元素

专题三、生物多样性测定及R语言分析

1、样方实测生物多样性：流程及要求
2、利用R语言分析计算生物多样性：α、β、γ多样性指数计算、物种多度分布模型的构建

专题四、植被类型及植被覆盖度图的编制

1、植被类型分类体系

2、ENVI制作植被类型图：

1）数据预处理：辐射定标、大气校正、图像裁剪。

2）分类方法-决策树分类：定义分类规则、获取阈值(光谱、NDVI等)、构建决策树、执行决策树、分类后处理。

3、ENVI分析植被覆盖度：VFC = (NDVI-NDVIsoil)/ (NDVIveg-NDVIsoil)

4、遥感制图：生成制图模板、自定义制图元素、输出制图结果

植被类型图

专题五、生物量与净初级生产力测定：实测及模型

1、生物量实测：收割法

2、生物量模型构建：单木和林分生物量模型

3、利用R语言构建生物量模型：回归分析、回归诊断、最佳模型选择（逐步回归、全子集回归）

4、植被净初级生产力(NPP)测定：光能利用率模型(CASA)

专题六、生态系统类型及服务价值评估

1、生态系统类型及空间格局

2、ENVI分析生态系统类型并制图

3、生态系统服务价值的涵义、类型及评估方法

4、当量因子法评估生态系统服务价值

专题七、物种适宜生境分析及分布图的制作

1、MAXENT最大熵模型简介

2、物种分布数据收集

3、环境变量数据收集

4、利用Maxent模型进行物种分布区预测

5、物种适宜生境分布图的制作

专题八、水生生态系统健康状况评价：生物完整性指数

1、生物完整性指数(IBI)涵义

2、生物完整性指数构建步骤

3、IBI候选指标构建与筛选：利用R语言进行相关性分析

4、IBI参数值及健康评价等级确定：利用R语言确定95%分位数

不同指标Pearson相关性图

专题九、景观生态学评价及景观指数计算

1、景观及景观生态学简述

2、常用的景观指数及其含义：蔓延度指数、散布与并列指数、聚集度指数等

3、利用Fragstats软件分析各种景观指数

专题十、生态环境状况综合评价指数

1、层次分析法及其基本步骤

2、指标权重计算方法：利用R语言进行主成分分析、计算权重

3、生态环境状况综合指数(EI)构建：生物丰度指数+植被覆盖指数+水网密度指数+土地胁迫指数+污染负荷指数+环境限制指数

层次分析法框架

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