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局部适应的分子标记筛选

      各种方法被用来揭示与适应性进化一致的分子印记。FST离群值分析(fst)扫描基因组以寻找基因座特异性效应,假设其反映了多样化或平衡选择,如较高的(阳性离群值)或更低(负离群值)遗传分化(FST)与中性背景水平相比,分别(Beaumont & Balding, 2004; Beaumont & Nichols, 1996; Excoffier, Hofer, & Foll, 2009; Hohenlohe, Phillips, & Cresko, 2010)。

       这种方法通常需要来自不同群体的大样本(Eveno et al,2008年),并没有考虑到环境的异质性。为此,基因型-环境关联(GEAs)标记等位基因频率与环境梯度密切相关的基因(Coop,Witonsky,Di Rienzo,& Pritchard,2010; de Villemereuil,Alberhot,Bazin,François,& Gaggiotti,2014; Schoville,Bouchard和François,2013年),经常揭示FST离群值分析无法检测到的自适应模式(Rellstab,Gugerli,Eckert,& Holderegger,2015)。

   

http://www.dtcms.com/a/38861.html

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