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计算重建dMRI与GrondTruth之间的角度误差图(AAE)代码实现(pytorch)

任务(具体实现)

处理扩散 MRI 数据,计算目标数据和方法数据之间的特征向量(eigenvectors)的余弦相似度,并生成角度误差图(AAE, Angular Error Map),最后保存为 NIfTI 文件。以下是代码的主要步骤:

  1. 数据加载

    • 使用 load_nifti 加载目标数据和方法数据。
    • 使用 read_bvals_bvecsgradient_table 加载 b-values 和 b-vectors,并构建梯度表。
  2. 特征向量计算

    • 使用 dti.TensorModel 对扩散数据进行张量拟合,得到特征值(evals)和特征向量(evecs)。
  3. 余弦相似度计算

    • 提取目标数据和方法数据的第一个特征向量,并计算它们之间的余弦相似度。
    • 将余弦相似度转换为角度误差(AAE)。

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