UKB-GWAS资源更新

最近英国UKB项目又发布了全基因测序的项目结果和发现，490,640名参与者的全基因组测序，调查了内部和跨种族的基因组关联，并发现了新的遗传学和临床见解。尽管大多数与疾病特征的关联主要观察在欧洲裔个体中，但在非洲裔和亚洲裔个体中也发现了强烈或新的信号。发现文章给出的数据资源更新了，这里分享一下：

UKB等位基因频率浏览器

UK Biobank Allele Frequency Browser (https://afb.ukbiobank.ac.uk/)是一个公开的变异等位基因频率资源，基于全基因组测序数据，涵盖490,640名UK Biobank参与者的SNP和indel变异。提供特定变异位点（如PCSK9、chr13-32398489-A-T等）的频率查询功能。

阿斯利康基因组研究中心PheWAS

阿斯利康PheWAS门户是一个基因-表型关联的存储库，用于从电子健康记录、问卷数据和英国生物银行发布的全基因组/外显子组上计算的连续性状中得出的表型。该门户中的所有基因组坐标均基于GRCh38。在分析之前，连续表型会进行基于秩的反正态转换。
罕见变异性坍缩分析关联统计数据在https://azphewas.com/网站可以获得。更新英国生物银行全基因组测序50万（v2）版本贡献的变异数据。 从英国生物银行荟萃分析中弃用少量连续表型。

SV关联数据

https://www.decode.com/summarydata/所有关联摘要统计数据均供一般研究使用，无需申请即可在访问时获取。

总结

与推断的阵列相比，UKB WGS识别到的变异增加了18.8倍，与全基因组测序（WGS）相比则增加了40倍以上。这与多项研究一致，这些研究强调了WGS相对于全外显子测序（WES）在识别编码变异方面的优势，特别是考虑到WGS的成本随着时间的推移而降低。根据以往的努力，这些信息也可以用来识别对变异容忍度较低的区域。WGS使我们能够识别出更多携带pLoF、P或LP变异的基因，这在评估LOF杂合携带者甚至人类敲除体的基因靶点方面提供了更多机会。WGS还使我们能够发现许多临床相关和疾病相关的结构变异（SVs）。
UKB的开放程度是世界上有目共睹的，期待国内能有类似的开放性数据库出现，贡献与全人类的健康事业，特别在AI结合下，相信会有大发现，大进展！
这一资源不仅能够促进五种不同祖先个体中罕见变异的改进型推断性能，而且还将有助于描述复杂区域如HLA、KIR和血红细胞抗原系统的变异，并作为未来人群规模研究的金标准。我们相信，利用全球科学家的综合专业知识将带来新的见解，这些见解将对我们理解人类疾病生物学产生实质性影响，从而推进寻找安全有效的药物。

参考文献

• https://www.nature.com/articles/s41586-025-09272-9#data-availability