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Spark 的 Shuffle 机制:原理与源码详解

Apache Spark 是一个分布式数据处理框架,专为大规模数据分析设计。其核心操作之一是 Shuffle,这是一个关键但复杂的机制,用于在某些操作期间在集群中重新分配数据。理解 Shuffle 需要深入探讨其目的、机制和实现,既包括概念层面,也包括源代码层面。本解释将详细、逐步且通俗易懂,即使是非专业人士也能清晰理解,同时提供技术深度以确保准确性。


目录

  1. 什么是 Shuffle,为什么需要它?
  2. Shuffle 的高层工作流程
  3. Shuffle 的详细步骤与原理
    • 步骤 1:触发 Shuffle
    • 步骤 2:Map 阶段(写入 Shuffle 数据)
    • 步骤 3:Shuffle 数据传输
    • 步骤 4:Reduce 阶段(读取 Shuffle 数据)
  4. 底层原理与优化
  5. 源代码解析
  6. 常见问题与缓解措施
  7. 结论

1. 什么是 Shuffle,为什么需要它?

概念概述

在 Spark 中,数据以分布式方式在集群的多个节点(计算机)上处理。每个节点处理数据的子集,称为 分区(Partition)。Spark 的操作分为两类:

  • 窄变换(Narrow Transformations)(如 map、filter):这些操作在单个分区上执行,无需数据在节点之间移动。
  • 宽变换(Wide Transformations)(如 groupBy 、join、reduceByKey):这些操作需要跨分区重新分配数据,因为一个分区的输出可能依赖于其他分区的数据。

Shuffle 是在宽变换期间重新分配数据的过程。它确保相关数据(例如,groupBy 中具有相同键的所有记录)被分组到同一节点上,以便进一步处理。

为什么需要 Shuffle?

        想象你在按城市对学生进行分组(groupBy 操作)。如果学生记录分散在不同的节点上,Spark 需要移动这些记录,以便同一城市的所有学生记录都集中在同一节点上。这种数据移动就是 Shuffle。没有 Shuffle,像分组、连接或跨分区聚合数据的操作将无法实现。

Shuffle 的挑战

  • 性能开销:Shuffle 涉及磁盘 I/O、网络 I/O 以及序列化/反序列化,是 Spark 中最昂贵的操作之一。
  • 复杂性:在分布式系统中管理数据移动需要仔细协调。

2. Shuffle 的高层工作流程

在高层,Shuffle 可分为两个阶段:

  1. Map 阶段:输入数据的每个分区由一个“映射器(Mapper)”任务处理,该任务按键分组数据并将其写入磁盘,格式适合重新分配。
  2. Reduce 阶段:“归约器(Reducer)”任务从所有映射器中获取分组数据,合并数据并生成最终输出。

这类似于 MapReduce 范式,其中:

  • 映射器 通过按键分区数据来准备数据。
  • 归约器 聚合或处理分区后的数据。

Shuffle 位于这两个阶段之间,负责集群中的数据传输。


3. Shuffle 的详细步骤与原理

        让我们将 Shuffle 过程分解为细致的步骤,解释每个阶段的原理和机制。我们将以 groupByKey 操作为例进行说明,因为它是一个典型的触发 Shuffle 的操作。

步骤 1:触发 Shuffle

发生什么:调用一个宽变换(例如 groupByKey),需要跨分区重新分配数据

原理

  • Spark 的执行模型基于 弹性分布式数据集(RDD) 或 数据集/数据框(Dataset/DataFrame),这些是分成多个分区的逻辑数据集合。
  • 当调用宽变换时,Spark 的查询规划器(通过 DataFrame 的 Catalyst 优化器 或 RDD 的血缘关系)检测到数据依赖跨越分区边界。
  • 这会在 Spark 的有向无环图(DAG)调度器中触发一个 阶段边界(Stage Boundary)。为 Shuffle 操作创建一个新的阶段。

示例

val rdd = sc.parallelize(Seq(("A", 1), ("B", 2), ("A", 3), ("B", 4)))
val grouped = rdd.groupByKey()

        这里,groupByKey 要求将键为“A”的所有记录放在一个分区,键为“B”的所有记录放在另一个分区。这种重新分配就是 Shuffle。

源码分析
        在 Spark 的 DAGScheduler(类 org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler)中,submitJob 方法分析 RDD 血缘关系并识别 Shuffle 依赖:

def submitJob[T](rdd: RDD[T],func: (TaskContext, Iterator[T]) => _,partitions: Seq[Int],callSite: CallSite,resultHandler: (Int, U) => Unit,properties: Properties): JobId = {// 检测 Shuffle 依赖并在需要时创建新阶段
}

当检测到 Shuffle 依赖(通过 ShuffleDependency)时,会创建一个新的 ShuffleMapStage。

步骤 2:Map 阶段(写入 Shuffle 数据)

发生什么:每个映射器任务处理其分区,按键分组数据,并将结果写入磁盘,格式优化用于 Shuffle。

原理

  • 按键分区:Spark 使用 分区器(Partitioner)(如 HashPartitioner 或 RangePartitioner)来确定每个键属于哪个归约器分区。对于 HashPartitioner ,分区计算为:分区=hash(键)mod  分区数
  • 缓冲与溢写:为避免将所有数据加载到内存,Spark 在内存中缓冲数据,并在缓冲区超过阈值(由 spark.shuffle.memoryFraction 控制)时溢写到磁盘。
  • 序列化:数据被序列化以减少内存和网络开销。
  • 磁盘写入:每个映射器将其输出写入本地磁盘,生成称为 Shuffle 文件 的文件,按归约器分区组织。

详细机制

  1. 映射器任务执行
    • 输入 RDD 的每个分区由一个映射器任务处理。
    • 对于每条记录,映射器应用变换(例如,为 groupByKey 提取键)。
    • 键被哈希,记录被分配到归约器分区。
  2. 外部 Shuffle 服务
    • Spark 使用 ExternalAppendOnlyMap 或 ExternalSorter 管理内存中的数据。这些数据结构缓冲键值对,并在内存不足时溢写到磁盘。
    • 溢写文件是临时的,存储在本地磁盘目录(通过 spark.local.dir 配置)。
  3. Shuffle 文件创建
    • 为每个归约器分区,映射器创建单独的文件或文件段。
    • 这些文件以包含元数据的格式写入(例如,每个归约器分区的偏移量)。

示例
对于 RDD Seq(("A", 1), ("B", 2), ("A", 3), ("B", 4)),假设有两个归约器分区:

  • 映射器 1 处理 ("A", 1), ("B", 2):
    • 键“A”哈希到分区 0。
    • 键“B”哈希到分区 1。
    • 写入两个文件:分区 0 的文件(("A", 1))和分区 1 的文件(("B", 2))。
  • 映射器 2 处理("A", 3), ("B", 4):
    • 同样,写入分区 0(("A", 3))和分区 1(("B", 4))。

源码分析

        ShuffleMapTask(类 org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask)协调 Map 阶段。关键逻辑在 runTask 中:

override def runTask(context: TaskContext): MapStatus = {// 反序列化 RDD 分区val deserializer = serializer.get()val rddIter = rdd.iterator(partition, context)// 使用 ShuffleWriter 写入 Shuffle 数据val writer = shuffleBlockResolver.getWriter(dep.shuffleId, partition.index, context)writer.write(rddIter.map(x => (dep.partitioner.getPartition(x._1), x)))writer.stop(success = true).get
}

ShuffleWriter(如 SortShuffleWriter)处理分区和磁盘写入。

步骤 3:Shuffle 数据传输

发生什么:归约器任务通过网络从所有映射器中获取 Shuffle 文件。

原理

  • 块管理器(BlockManager):Spark 的 BlockManager 负责管理数据块(包括 Shuffle 文件)。每个节点运行一个 BlockManager,为其他节点提供 Shuffle 文件。
  • 外部 Shuffle 服务:为将 Shuffle 文件服务与执行器生命周期解耦,Spark 使用外部 Shuffle 服务(一个独立进程)来提供 Shuffle 文件。这在动态分配场景中尤为有用。
  • 网络传输:归约器使用 HTTP 或基于 Netty 的传输从映射器节点获取 Shuffle 文件。文件以 块(Block) 的形式获取,Spark 通过流水线和压缩(由 spark.shuffle.compress 控制)优化这一过程。

详细机制

  1. 归约器请求
    • 每个归约器任务需要从所有映射器任务中获取其分配分区的数据。
    • 归约器查询 MapOutputTracker(驱动程序的一个组件)以获取其分区的 Shuffle 文件位置。
  2. 数据获取
    • 归约器使用 BlockManager 从映射器节点获取块。
    • 如果启用了外部 Shuffle 服务,则由其提供文件;否则,由映射器的执行器提供。
  3. 合并
    • 在获取数据时,归约器将来自多个映射器的流合并为单个流以进行处理。
    • Spark 可能使用 基于排序的 Shuffle(按键排序数据)或 基于哈希的 Shuffle(按键分组而不排序),具体取决于操作。

示例
对于分区 0(键“A”):

  • 归约器 0 从映射器 1 获取分区 0 的 Shuffle 文件(("A", 1)),从映射器 2 获取分区 0 的文件(("A", 3))。
  • 数据合并为单个流:(("A", 1), ("A", 3)。

源码分析
    BlockTransferService(如 NettyBlockTransferService)处理数据获取:

def fetchBlocks(host: String,port: Int,execId: String,blockIds: Array[String],listener: BlockFetchingListener): Unit = {// 启动 Shuffle 块的网络传输
}

MapOutputTracker(类 org.apache.spark.MapOutputTracker)提供 Shuffle 文件位置的元数据。

步骤 4:Reduce 阶段(读取 Shuffle 数据)

发生什么:归约器任务处理获取的数据以生成最终输出。

原理

  • 聚合:对于像 groupByKey 这样的操作,归约器将给定键的所有值分组。对于 reduceByKey,它应用归约函数来组合值。
  • 内存管理:归约器在内存中缓冲数据,并在需要时溢写到磁盘,类似于映射器。
  • 输出:归约器将最终输出写入新的 RDD 分区或 DataFrame,供后续操作使用。

详细机制

  1. 数据处理
    • 归约器迭代获取的数据,按需分组或聚合。
    • 对于 groupByKey,它为每个键创建值列表(例如,("A", [1, 3]))。
  2. 溢写管理
    • 如果数据超过内存限制,Spark 使用 ExternalSorter 溢写到磁盘。
  3. 输出写入
    • 最终输出写入新分区,根据存储级别(例如 MEMORY_AND_DISK)存储在内存或磁盘中。

示例
对于 groupByKey:

  • 归约器 0 处理 ("A", 1), ("A", 3),生成 ("A", [1, 3])
  • 归约器 1 处理 ("B", 2), ("B", 4),生成 ("B", [2, 4])

源码分析
   ResultTask(类 org.apache.spark.scheduler.ResultTask)或 ShuffleMapTask 中的归约器逻辑处理数据:

override def runTask(context: TaskContext): U = {val iter = dep.rdd.iterator(partition, context)func(context, iter)
}

4. 底层原理与优化

关键原理

  • 确定性分区:分区器确保具有相同键的所有记录到达同一归约器,以实现正确的分组或聚合。
  • 容错性:Shuffle 文件存储在磁盘上,因此如果节点失败,Spark 可以重新计算或重新获取数据。
  • 本地化:Spark 尝试在数据所在节点上运行任务,以减少网络传输。

优化

  1. 合并 Shuffle 文件
    • Spark 通过合并文件(由 spark.shuffle.consolidateFiles 启用)减少打开的文件句柄数量,而不是为每个映射器-归约器对创建单独文件。
  2. 基于排序的 Shuffle
    • 在 Spark 1.2 中引入,基于排序的 Shuffle 按键排序数据,相比基于哈希的 Shuffle 减少内存使用。
    • 由 spark.shuffle.manager 控制(默认设置为 sort)。
  3. 压缩
    • Shuffle 数据被压缩以减少磁盘和网络 I/O(由 spark.shuffle.compress 和 spark.shuffle.spill.compress 启用)。
  4. 外部 Shuffle 服务
    • 通过独立于执行器提供 Shuffle 文件,提高可靠性。
  5. Tungsten
    • Spark 的 Tungsten 引擎通过使用堆外内存和高效序列化(在 DataFrame/DataSet API 中使用)优化 Shuffle 期间的内存使用。

5. 源代码解析

        让我们深入探讨 Spark 源代码(基于 Spark 3.x)的关键类和方法,以理解 Shuffle 的实现。代码主要用 Scala 编写,位于 org.apache.spark 包中。

关键类

  1. ShuffleDependency(org.apache.spark.ShuffleDependency):

    • 表示 RDD 之间的 Shuffle 依赖。
    • 包含分区器和 Shuffle ID。
    class ShuffleDependency[K, V, C](@transient val rdd: RDD[_ <: Product2[K, V]],val partitioner: Partitioner,val serializer: Serializer = SparkEnv.get.serializer,val keyOrdering: Option[Ordering[K]] = None,val aggregator: Option[Aggregator[K, V, C]] = None,val mapSideCombine: Boolean = false)extends Dependency[Product2[K, V]] {// Shuffle 的元数据
    }
    
  2. ShuffleMapTask(org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask):

    • 执行 Map 阶段,写入 Shuffle 数据。
    • 使用 ShuffleWriter 分区和写入数据。
  3. SortShuffleWriter(org.apache.spark.shuffle.sort.SortShuffleWriter):

    • 实现基于排序的 Shuffle,按键排序数据并写入磁盘。
    def write(records: Iterator[Product2[K, V]]): Unit = {val sorter = new ExternalSorter[K, V, _](context, dep.aggregator, None, dep.keyOrdering, serializer)sorter.insertAll(records)// 将排序后的数据写入 Shuffle 文件
    }
    
  4. BlockManager(org.apache.spark.storage.BlockManager):

    • 管理 Shuffle 文件并将其提供给归约器。
    • 使用 DiskBlockManager 进行磁盘存储,BlockTransferService 进行网络传输。
  5. MapOutputTracker(org.apache.spark.MapOutputTracker):

    • 跟踪集群中 Shuffle 文件的位置。
    def getMapSizesByExecutorId(shuffleId: Int, reduceId: Int): Seq[(BlockManagerId, Long)] = {// 返回归约器的 Shuffle 文件位置和大小
    }
    

代码中的工作流程

  1. 阶段创建
    • DAGScheduler.submitMissingTasks 为 Map 阶段创建 ShuffleMapTask 实例。
  2. Map 阶段
    • ShuffleMapTask.runTask 调用 SortShuffleWriter.write 分区并写入数据。
  3. 数据获取
    • 归约器使用 BlockManager.getRemoteBytes 获取 Shuffle 块。
  4. Reduce 阶段
    • ResultTask 或归约器逻辑处理获取的数据。

6. 常见问题与缓解措施

问题

  1. 性能瓶颈
    • 过多的磁盘 I/O 或网络传输可能减慢 Shuffle。
    • 缓解措施:增加内存(spark.memory.fraction),启用压缩,或使用更多分区以并行化。
  2. 数据倾斜
    • 如果某些键的数据显著较多,某些归约器可能成为瓶颈。
    • 缓解措施:使用加盐(为键添加随机前缀)或自定义分区器。
  3. 溢写到磁盘
    • 如果内存不足,Spark 会溢写到磁盘,增加 I/O。
    • 缓解措施:增加执行器内存或调整 spark.shuffle.memoryFraction

调优参数

  • spark.shuffle.compress:为 Shuffle 文件启用压缩。
  • spark.shuffle.spill.compress:为溢写数据启用压缩。
  • spark.shuffle.consolidateFiles:减少 Shuffle 文件数量。
  • spark.shuffle.partitions:设置归约器分区数(默认值为 200)。

7. 结论

        Spark 的 Shuffle 是分布式数据处理中宽变换的关键机制。通过跨分区重新分配数据,它确保像 groupByjoin 和 reduceByKey 这样的操作能够正确执行。该过程包括 Map 阶段(写入分区数据)、数据传输阶段(通过网络获取数据)和 Reduce 阶段(处理数据)。在代码层面,类如 ShuffleMapTaskSortShuffleWriter 和 BlockManager 协调这一复杂操作。

        对于初学者,可以将 Shuffle 想象为一个大规模的排序和配送系统:数据按键排序,包装成箱子(Shuffle 文件),通过网络运送,并由归约器拆箱以生成最终结果。尽管 Shuffle 资源密集,但 Spark 的优化(如基于排序的 Shuffle、压缩、外部 Shuffle 服务)使其高效且可扩展。

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