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AlphaFold3 rigid_utils 模块的 quat_to_rot 函数的功能是把四元数转换为旋转矩阵,函数利用预定义的四元数到旋转矩阵的转换表 _QTR_MAT 来简化计算。

理解四元数到旋转矩阵的转换

源代码:

_quat_elements = ["a", "b", "c", "d"]
_qtr_keys = [l1 + l2 for l1 in _quat_elements for l2 in _quat_elements]
_qtr_ind_dict = {key: ind for ind, key in enumerate(_qtr_keys)}def _to_mat(pairs):mat = np.zeros((4, 4))for pair in pairs:key, value = pairind = _qtr_ind_dict[key]mat[ind // 4][ind % 4] = valuereturn mat_QTR_MAT = np.zeros((4, 4, 3, 3))
_QTR_MAT[..., 0, 0] = _to_mat([("aa", 1), ("bb", 1), ("cc", -1), ("dd", -1)])
_QTR_MAT[..., 0, 1] = _to_mat([("bc", 2), ("ad", -2)])
_QTR_MAT[..., 0, 2] = _to_mat([("bd", 2), ("ac", 2)])
_QTR_MAT[..., 1, 0] = _to_mat([("bc", 2), ("ad", 2)])
_QTR_MAT[..., 1, 1] = _to_mat([("aa", 1), ("bb", -1), ("cc", 1), ("dd", -1)])
_QTR_MAT[..., 1, 2] = _to_mat([("cd", 2), ("ab", -2)])
_QTR
http://www.dtcms.com/wzjs/357252.html

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