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单细胞簇鉴定

news 来源：原创 2025/6/16 12:35:45

细胞类型的鉴定

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我认为"0",‘1’,‘3’,‘4’,‘5’,'10’是上皮细胞，第一步的大致分，同时我们也看到12,13,15,19也有上皮的表达，但是没有聚类在一起，我们先保留

我们看第2簇，这个是代表的是成纤维细胞

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继续我们看第6簇，这个是代表的是平滑肌细胞（Smooth muscle cells）

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继续我们看第7簇，这个是代表的是小鼠胃底腺的主细胞

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我们看第8簇，这个是代表的是基底样上皮细胞

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我们看第9簇，这个是代表的是内皮细胞，同时17簇也是内皮细胞

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我们看第11簇，这个是代表的是T 细胞

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12和15簇是神经内分泌细胞enteroendocrine cells

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Cluster 13：肠型吸收上皮细胞（Enterocyte-like epithelial cells）

![在这里插入图片描述](https://i-blog.csdnimg.cn/direct/5f919206e6b845b89a3714ad4c7e48f3.png

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Cluster 14：巨噬细胞没啥好说的

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16簇基因中标志性的 Tpsb2 和 Cd63 强烈提示这群是 肥大细胞（mast cells）。

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19簇Brush cells / Tuft cells（刷状细胞）表达 Trpm5, Gnat3, Avil, Plcg2, Dclk1 等经典刷状细胞 marker。常出现在胃肠道，负责化学感应与免疫信号

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Cluster 20：再生型或 EMT-like 上皮细胞（Regenerative/EMT-like epithelial cells）

表达 Slpi, Igfbp5/6, Dcn, Rspo1, Muc16, 结合间充质与分泌特征，推测为组织修复/转分化状态的上皮样细胞在这里插入图片描述

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最终我们鉴定万所有的细胞簇

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