MRIcron画大脑叠加图

MRIcron 是一个跨平台的 NIfTI 格式图像查看器。它可以加载多层图像、生成体素渲染并绘制感兴趣的体素。它还提供用于将 DICOM 图像转换为 NIfTI 格式的 dcm2nii 和用于统计的 NPM。

1. MRIcron下载：

https://www.nitrc.org/projects/mricron/

选择windows版本点击下载

点击I Agree

2. 使用教程：

MRIcron 强大的是可以加载多层图像。
（1）首先选择背景图像， file 菜单的 open templates 命令。打开一个背景底图ch2bet。

（2）在背景上添加其他图像，只需选择 overlap ， add 图像。比如我选择 放在自己自定义的一个example.nii图像。就可以把自定义的nii图像在背景图ch2bet上显示了。

对Backgroud背景图像使用 一般使用“Grayscale”配色，点击图片可以将右边的“Grayscale”灰度配色方案运用到Backgroud背景图像上。数字表示图像强度范围为 从 45 到 120，值 低于45 将显示为全黑，高于120 将显示为白色。

我们也可以通过打开colorbar来检查图像值的范围，点击：

显示colorbar:

colorbar上的值确实比120高的值为白色，低于45为全黑了。这个按钮用左键点colorbar是横着的，用右键点击colorbar是竖着的。这个按钮左边是取消colorbar的显示。

接下来，我们可以对叠加层使用其他的配色。比如说我这里对example.nii使用red_otto配色。点击将右边的red_otto配色运用到example.nii图像上，就画好叠加图了。