rs-fMRI_一篇文章中分析方法的梳理（翻译）

文章

APOE ε4 influences within and between network functional connectivity in posterior cortical atrophy and logopenic progressive aphasia

2024美国梅奥诊所发表在Alzheimers Dement. 的文章。

“APOE ε4等位基因对后皮质萎缩与进行性语言障碍型失语症的网络内及网络间功能连接的影响”

fMRI方法

Image acquisition

3T volumetric MRI。获取睁眼静息状态的fMRI。

Image processing

1）预处理_CONN functional connectivity toolbox，链接www.nitrc.org/projects/conn.

具体包括：

弃用前10个时间点以获取稳态磁化强度；

切面时间校正、重新对齐（运动估计与校正）、异常值检测；

分割同时标准化至MNI模板空间；

使用6毫米半高全宽的高斯核作平滑处理；

对白质和脑脊液进行伪影回归；

基于6个头动参数及其1阶、2阶导数完成去噪；

带通滤波器过滤0.01-0.1Hz频带以外的信号以降低低频偏移和噪声影响。

2）分区_皮层和皮层下脑区。借助：Harvard-Oxford atlas和CONN‘s network parcellations atlas。方法：Independant Component Analysis（ICA推断的独立成分包含头动噪声、血管搏动噪声、扫描仪噪声等，需要结合闹网络模板进行筛选）。

3）信号分析_BOLD。

具体包括：

各ROI的平均BOLD时间序列提取；

在ROI间作Pearson’s R correlation coefficients计算、Fisher‘s R-to-Z转换。