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UniRef100 ID 转换 UniProtKB ID

UniProtKB ID(UniProt Knowledgebase Identifier)是 UniProt数据库中蛋白质条目的唯一标识符,包括两个数据库分支:

  • Swiss-Prot(人工注释,高质量)

  • TrEMBL(自动注释)

通常有两种形式:

类型示例
Entry NameCBPB2_HUMAN
Accession ID(常用)Q96IY4P12345A0A8B8B5A6

AlphaFold预测结构是基于UniProtKB accession ID生成的,如:

https://alphafold.ebi.ac.uk/files/AF-Q96IY4-F1-model_v4.pdb

UniRef100 是 UniProt Reference Clusters(UniRef)数据库的一个层级。

  • UniRef100:将 100% 序列相同 的蛋白质聚类成一个单元(包括不同物种中相同序列的蛋白)

  • 每个聚类有一个 代表序列(通常来自 UniProtKB),ID 形式如:

    UniRef100_Q96IY4 UniRef100_A0A8B8B5A6 UniRef100_UPI000C0409EB

    UniRef100 ID 代表整个 完全一致的序列簇,而不是单个蛋白。

http://www.dtcms.com/a/198085.html

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