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【数据分析】酵母实验多指标数据的 R 语言分析与可视化

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文章目录

    • 介绍
    • 加载必要的R包
    • 数据下载
    • 定义函数
    • 发育分析(development analysis)
      • 数据导入与预处理
      • 数据子集创建
      • 绘图
      • 模型分析
      • 两两比较
    • 生存分析(survival analysis)
      • 数据导入与预处理
      • 数据子集创建
      • 绘图
      • 数据转换与模型分析
    • 性别分析(sex analysis)
      • 数据导入与预处理
      • 绘图
      • 数据导入与预处理
  • 数据子集创建
      • 数据转换与模型分析
    • 翅膀大小分析(Wing size analysis)
      • 数据导入与预处理
      • 数据子集创建
      • 绘图
      • 模型分析
    • 感染状态浓度分析(infection_status concentration analysis)
      • 数据导入与绘图
      • 模型分析
      • 数据导入与绘图
    • 描述性统计(descriptive statistics)
    • 废物氮管理分析(waste nitrogen management analysis)
      • 数据导入与预处理
      • 尿酸酶分析
      • 尿酸分析
      • 蛋白质分析
      • 描述性统计
    • 核黄素分析(riboflavin analysis)
    • 产卵分析(OVIPOSITION analysis)
    • 刺激分析(Stimulation analysis)
    • 总结
    • 系统信息

介绍

围绕酵母相关的多个实验数据集进行数据处理、可视化和统计分析。其目的在于探究不同感染状态、性别、处理条件等因素对多种实验指标(如发育时间、存活率、性别比例、翅膀大小、酵母浓度、尿酸酶活性、尿酸含量、蛋白质含量、核黄素浓度、产卵数等)的影响。以下是对教程的详细解释:

  1. 加载必要的 R 包:加载了一系列用于数据处理、可视化、统计分析等的 R 包,如readxl(读取 Excel 文件)、ggplot2(数据可视化)、forcats(处理因子变量)、car(回归分析相关)等。
  2. 定义函数:定义了median.quartile函数,用于计算数据的中位数、下四分位数和上四分位数,以便在后续绘图中使用。
  3. 发育分析(develop

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