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AlphaFold3 input_pipeline 模块 nonensembled_transform_fns 函数执行非集成（non-ensembled）的数据变换操作，用于 AlphaFold3 输入数据预处理，主要负责：

1. 转换输入特征（如 MSA, templates, 序列 mask）。

2. 生成骨架特征（backbone frames, torsion angles）。

3. 处理结构信息（如原子坐标转换）。

源代码：

def nonensembled_transform_fns(common_cfg, mode_cfg):"""Input pipeline data transformers that are not ensembled."""transforms = [data_transforms.cast_to_64bit_ints,data_transforms.correct_msa_restypes,data_transforms.squeeze_features,data_transforms.randomly_replace_msa_with_unknown(0.0),data_transforms.make_seq_mask,data_transforms.make_msa_mask,data_transforms.make_hhblits_profile,]if common_cfg.use_templates:transforms.extend([data_transforms.fix_templates_aatype,data_transforms.make_template_mask,data_transforms.make_pseudo_beta("template_"),])if common_cfg.use_template_torsion_angles:transforms.extend([data_transforms.atom37_to_torsion_angles("template_"),])transforms.extend([data_transforms.make_atom14_masks,])if mode_cfg.supervised:transforms.extend([data_transforms.make_atom14_posit