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UCSF ChimeraX 是一款由美国加州大学旧金山分校（UCSF）开发的下一代分子可视化软件，是经典的 UCSF Chimera 的继任者。它集成了强大的分子结构可视化、分析、建模和动画功能，广泛应用于结构生物学、药物设计、分子建模等领域。

1. 下载安装：

Download UCSF ChimeraX

2. 常用的commands 命令

文件操作

功能	命令示例
打开结构文件（本地）	open ~/protein.pdb
打开 PDB 数据库结构	open 1ubq
关闭全部结构	close all
保存结构文件	save ~/output.pdb format pdb
保存图像（高分辨）	save ~/image.png supersample 3 dpi 300
保存会话	save project.cxs
查看模型编号	info models

结构选择

通用结构：

#modelID/chainID:residueRange@atom

功能	命令
选择第 51 号残基（链 A）	select #1/A:51
选择 A 链所有残基	select #1/A
选择残基 10 到 20	select #1/B:10-20
选择某原子（CA）