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文章目录

    • 介绍
    • 加载R包
    • 数据下载
    • 导入数据
    • 数据预处理
    • 生存分析
    • 画图
    • 输出图片
    • 其他标记物的分析
    • 总结
    • 系统信息

介绍

分析生存数据与多种生物标志物之间的关系。它通过Cox比例风险模型来评估不同生物标志物(如SSC4D、UPB1、SERPINE1等)对特定疾病(如心力衰竭HF、2型糖尿病T2D、心血管疾病CVD)发生风险的影响。代码主要分为以下几个步骤:

  1. 数据准备:加载必要的R包,读取数据集protein_Disease.RDS,并对数据进行预处理,包括变量的重新编码、缺失值处理等。
  2. 变量离散化:将年龄等连续变量离散化为分类变量,便于后续分析。
  3. 生存分析:对于每个生物标志物,代码首先筛选出特定疾病状态(如HF_status=1)的数据,然后使用Cox比例风险模型拟合生存数据,模型中包含生物标志物的限制性立方样条(RCS)以及一系列协变量(如年龄、性
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