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村官 举措 村级网站建设,免费网站的平台,做ar的网站,wordpress开场目录 1. 项目需求 2. 网络选择 2.1 UNet模块 2.2 TransUnet 2.2.1 SE模块 2.2.2 CBAM 2.3 关键代码 3 对比试验 3.1 unet 3.2 transformerSE 3.3 transformerCBAM 4. 结果分析 5. 推理 6. 下载 1. 项目需求 本文需要做的工作是基于CNN和Transformer的心脏左心室…

目录

1. 项目需求

2. 网络选择

2.1 UNet模块

2.2 TransUnet

2.2.1 SE模块

2.2.2 CBAM

2.3 关键代码

3 对比试验

3.1 unet

3.2 transformer+SE

3.3 transformer+CBAM

4. 结果分析

5. 推理

6. 下载


1. 项目需求

本文需要做的工作是基于CNN和Transformer的心脏左心室分割,需要在Transformer网络中进行改进,以求期待更好的分割结果

数据集的样式如下:

这里的标签是这样的:

因为是二值的分割任务,这里心脏的左心室标签全部标记为1,看起来是全黑的,可以可视化看看

2. 网络选择

本文选择的网络是UNet和TransUnet,并且在TransUnet中加入注意力模块

2.1 UNet模块

Unet网络是一种用于图像分割任务的深度学习架构,由Ronneberger等人于2015年提出。Unet的结构类似于自编码器,采用对称的结构,分为编码器和解码器两部分。

编码器部分由卷积层和池化层构成,用于提取图像的特征并逐渐减小空间分辨率。解码器部分则由反卷积层和卷积层构成,用于将编码器提取的特征映射回原始分辨率,并生成分割结果。

在训练过程中,Unet通过将输入图像与对应的标签图像一起输入网络,利用损失函数计算网络输出与标签之间的差异,并通过反向传播算法调整网络参数,使得网络输出能够尽可能地接近标签图像。

Unet网络在图像分割任务中表现出色,尤其在医学图像分割等领域取得了很好的效果。其优点包括较小的参数数量、对少量训练样本的高效利用,以及良好的分割精度。

2.2 TransUnet

TransUNet是一种基于Transformer的图像分割模型,它结合了Transformer的自注意力机制和UNet的编码-解码结构。这个模型由微软研究院提出,旨在应用于医学图像分割任务。

TransUNet模型的架构主要分为两部分:Encoder部分和Decoder部分。Encoder部分主要利用Transformer的自注意力机制来提取图像的全局特征,而Decoder部分则类似于UNet的解码器,用于将特征映射回原始图像的分辨率并生成分割结果。

相较于传统的卷积神经网络,TransUNet模型在处理长程依赖关系和全局特征提取方面具有优势。它可以学习到更加细致和全局的特征表示,有助于提升图像分割的准确性和性能。

总的来说,TransUNet模型是一种结合了Transformer和UNet特点的先进图像分割模型,适用于医学图像等领域的任务。

2.2.1 SE模块

SE模块(Security Enhancement Module)是一种用于增强系统安全性的软件或硬件模块。它通常被用于加固系统的安全性,提高系统的防护能力,防止恶意攻击和数据泄露。SE模块可以实现诸如数据加密、访问控制、身份认证等功能,从而确保系统和数据的安全。在当今信息安全日益重要的环境下,SE模块成为许多系统和应用程序的重要组成部分,帮助用户保护其重要信息和资产不受损害。

2.2.2 CBAM

CBAM模块是一种用于解决关注机制(Attention Mechanism)的问题的模块。它结合了通道注意(Channel Attention)和空间注意(Spatial Attention)的方法,从而能够更加有效地捕捉输入特征图中的重要信息。通过CBAM模块,神经网络可以学习到更加具有区分度的特征表示,从而提升模型在各种视觉任务中的性能表现。CBAM模块已经在许多计算机视觉领域得到了成功的应用,成为提升模型性能的重要工具之一。

2.3 关键代码

代码部分,这里放了三个代码,分别是unet、transformer+SE、transformer+CBAM,可以自行选择

    # 1. cbam  注意力机制# model =TransUnet(in_channels=3,img_dim=224,vit_blocks=1,#              vit_dim_linear_mhsa_block=512, classes=nc)# 添加模块代码# model.vit.mlp_head.add_module('cbam', CBAM(1024))# model.vit.transformer.layers[0].mhsa.to_qvk.add_module('cbam', CBAM(1024))# model.vit.transformer.layers[0].mhsa.W_0.add_module('cbam', CBAM(1024))##2.  unetmodel = U_Net(img_ch=3,output_ch=nc)# # # 3. se# model =TransUnet(in_channels=3,img_dim=224,vit_blocks=1,#              vit_dim_linear_mhsa_block=512, classes=nc)## # 添加模块代码# model.vit.mlp_head.add_module('se', SE_Block(1024))# model.vit.transformer.layers[0].mhsa.to_qvk.add_module('se', SE_Block(1024))# model.vit.transformer.layers[0].mhsa.W_0.add_module('se', SE_Block(1024))

3 对比试验

因为对比试验,其他的参数都是一样的,如下所示:

    "train parameters": {"batch size": 4,"lr": 0.001,"lrf": 0.01,"ct": false,"epochs": 100,"num classes": 2,"best epoch": 96

3.1 unet

最好epoch 

    "epoch:97": {"train log:": {"info": {"pixel accuracy": [0.9996318221092224],"Precision": ["0.9721"],"Recall": ["0.9731"],"F1 score": ["0.9726"],"Dice": ["0.9726"],"IoU": ["0.9466"],"mean precision": 0.9721232056617737,"mean recall": 0.9730567932128906,"mean f1 score": 0.9725897908210754,"mean dice": 0.9725897908210754,"mean iou": 0.9466421008110046}},"val log:": {"info": {"pixel accuracy": [0.9994057416915894],"Precision": ["0.9563"],"Recall": ["0.9568"],"F1 score": ["0.9566"],"Dice": ["0.9566"],"IoU": ["0.9168"],"mean precision": 0.9563419818878174,"mean recall": 0.9568029046058655,"mean f1 score": 0.956572413444519,"mean dice": 0.956572413444519,"mean iou": 0.916759729385376}

3.2 transformer+SE

最好的epoch:

       "train log:": {"info": {"pixel accuracy": [0.9997045397758484],"Precision": ["0.9780"],"Recall": ["0.9780"],"F1 score": ["0.9780"],"Dice": ["0.9780"],"IoU": ["0.9569"],"mean precision": 0.9780052900314331,"mean recall": 0.9779714941978455,"mean f1 score": 0.9779884219169617,"mean dice": 0.9779884219169617,"mean iou": 0.9569249749183655}},"val log:": {"info": {"pixel accuracy": [0.9994567036628723],"Precision": ["0.9588"],"Recall": ["0.9619"],"F1 score": ["0.9604"],"Dice": ["0.9604"],"IoU": ["0.9237"],"mean precision": 0.9588128328323364,"mean recall": 0.9618959426879883,"mean f1 score": 0.9603518843650818,"mean dice": 0.9603519439697266,"mean iou": 0.9237278699874878}}},

 

3.3 transformer+CBAM

最好的epoch:

    "epoch:96": {"train log:": {"info": {"pixel accuracy": [0.9996169209480286],"Precision": ["0.9724"],"Recall": ["0.9705"],"F1 score": ["0.9714"],"Dice": ["0.9714"],"IoU": ["0.9445"],"mean precision": 0.9724175333976746,"mean recall": 0.9704613089561462,"mean f1 score": 0.9714384078979492,"mean dice": 0.971438467502594,"mean iou": 0.9444631338119507}},"val log:": {"info": {"pixel accuracy": [0.9994094967842102],"Precision": ["0.9582"],"Recall": ["0.9554"],"F1 score": ["0.9568"],"Dice": ["0.9568"],"IoU": ["0.9171"],"mean precision": 0.9581836462020874,"mean recall": 0.9553713798522949,"mean f1 score": 0.9567754864692688,"mean dice": 0.956775426864624,"mean iou": 0.9171327948570251}}

4. 结果分析

指标如下:

unettransformer+setransformer+cbam
0.95660.96040.9568
        0.9168        0.92370.9171

上述的指标均为验证集上的指标

其中第一行为dice、第二行为iou

可以发现,transformer+se的效果是最好的

5. 推理

运行命令:streamlit run infer.py

6. 下载

关于本项目代码和数据集、训练结果的下载:【更换数据集进行训练的话,参考readme文件,pip requirements文件就行了】

基于transformer和unet卷积神经网络对心脏左心室分割的研究、已经训练完成资源-CSDN文库

包含数据集、完整代码、和训练结果:


关于神经网络的改进:图像分类网络改进_听风吹等浪起的博客-CSDN博客 

http://www.dtcms.com/wzjs/480915.html

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