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在Tomcat中的webapps目录和使用java -jar运行内置Tomcat的访问方式有以下区别：

1. 部署方式：

   • Tomcat中的webapps目录：将打包好的WAR文件放置在Tomcat的webapps目录下，Tomcat会自动解压并部署该应用。
   • 内置Tomcat：通过java -jar命令运行Spring Boot应用，Spring Boot会启动一个内置的Tomcat服务器。

2. 访问路径：

   • Tomcat中的webapps目录：应用的访问路径通常是http://<server>:<port>/<context-path>，其中<context-path>是WAR文件名（不包括.war后缀）。
   • 内置Tomcat：应用的访问路径通常是http://<server>:<port>/，默认情况下没有<context-path>，可以通过配置文件设置。

3. 配置管理：

   • Tomcat中的webapps目录：需要手动管理Tomcat的配置文件（如server.xml、context.xml等），并且可以在Tomcat的管理控制台中进行管理。
   • 内置Tomcat：所有配置都在Spring Boot的配置文件（如application.properties或application.yml）中进行管理，简化了配置过程。

4. 启动和停止：

   • Tomcat中的webapps目录：需要启动和停止Tomcat服务器来部署和卸载应用。
   • 内置Tomcat：通过java -jar命令启动应用，停止时直接终止进程即可。

5. 依赖管理：

   • Tomcat中的webapps目录：需要确保Tomcat服务器的版本和应用程序的依赖兼容。
   • 内置Tomcat：Spring Boot会自动管理Tomcat的版本和依赖，减少了兼容性问题。

总结来说，使用内置Tomcat的Spring Boot应用简化了部署和配置过程，更加适合微服务和快速开发，而传统的Tomcat部署方式适合于需要集中管理和配置的场景。