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在生物医学科研中，脑区的 3D 可视化是呈现实验结果、解析脑结构功能的重要手段。R 语言凭借rgl和Rvcg等工具包，可高效实现小鼠全脑及特定脑区（如 CA1 区）的立体渲染，且代码可复用性强。本文将从环境搭建、数据准备、代码实现到结果导出，手把手带你完成小鼠脑图谱 3D 绘图，小白也能快速上手！
一、核心原理与工具包说明
3D 渲染的核心是基于网格（Mesh）文件（OBJ 格式）构建立体结构，再通过工具包对模型进行颜色、透明度、视角等参数调整。本次用到的两个关键 R 包功能如下：
| 工具包 | 核心作用 | 关键函数 |
|---|---|---|
rgl | 3D 场景渲染与交互，支持视角调整、图像导出 | shade3d()（模型渲染）、view3d()（视角控制）、rgl.snapshot()（图像保存） |
Rvcg | 读取和处理 OBJ 格式的网格文件，为 3D 渲染提供数据基础 | readOBJ()（读取 OBJ 文件） |
二、前提准备：获取小鼠脑区 OBJ 文件
R 语言无法直接生成脑区模型，需提前从权威数据库下载标准 OBJ 文件，确保脑区结构的准确性（数据来自 Allen 脑科学研究所，为领域通用标准）。<