荧光原位杂交(FISH)-实验操作-011
一、实验流程总览
该技术用于检测组织中 miRNA 的空间表达,采用荧光原位杂交(FISH)方法。流程主要包括以下几个阶段:
-
组织解剖与预处理
-
预杂交处理
-
探针杂交
-
洗涤去杂
-
制片观察
-
关键试剂配制与注意事项
二、详细步骤整理
1. 组织解剖与预处理
-
麻醉消毒:将动物放在冰上麻醉,75%酒精消毒 3 分钟后用 PBS 清洗。
-
组织解剖:在 PBS 或 Grace’s Insect Medium 中解剖所需组织。
-
组织固定:4% 多聚甲醛 (PFA) 室温固定 1 小时。
-
通透化处理:用 800 µL PBTT 处理 15 分钟,再用 PBTT 洗涤 3 次,每次 5 分钟。
-
PBS 洗涤:PBS 洗涤 2 次,每次 5 分钟。
-
转入杂交液:用 1:1 的 PBT:RNA 杂交液洗涤,储存在 RNA 杂交液中。
2. 预杂交
-
RNA 杂交液煮沸 5 分钟,冰上骤冷 5 分钟。
-
将样品加入杂交液中,在 56℃ 下孵育 2 小时。
3. 探针杂交
-
探针以 1:50 至 1:2000 的比例稀释于 RNA 杂交液中。
-
探针加热至 80℃ 5 分钟后冰浴骤冷 5 分钟(若探针短于 50nt 且无复杂结构可省略)。
-
样品加入含探针的杂交液中,在 56℃ 杂交 12 小时(30-80nt 短探针孵育 30 分钟至 2 小时)。
-
杂交结束后,转入 DAPI 染色液中染色 30 分钟。
4. 洗涤
-
杂交液预热至 56℃,洗涤样品 3 次,每次 15 分钟。
-
使用 PBT 洗涤 5 分钟。
-
转入 PBS 中再洗涤 5 分钟。
5. 制片
-
在体式荧光显微镜下操作:
-
滴加抗淬灭剂于载玻片中央,放置样品,解剖脂肪体碎块分散。
-
缓慢下压盖玻片,避免左右移动。
-
吸除多余抗淬灭剂,用指甲油封闭四周,避光晾干保存。
-
三、关键试剂组成(RNA 杂交液)
中文名 | 英文名 | 体积 (ml) |
---|---|---|
甲酰胺 | Formamide | 25 |
20× SSC 缓冲液 | 20× SSC | 12.5 |
肝素(5mg/ml) | Heparin | 0.5 |
酵母 tRNA | Yeast tRNA (50mg/ml) | 0.5 |
柠檬酸 | Citric acid (0.5M, pH=6.0) | 0.92 |
DEPC 水 | DEPC-treated H2O | 10.33 |
吐温 20 | 20% Tween 20 | 0.25 |
注:酵母 tRNA 需临用前添加。
四、说明与注意事项
-
固定液说明:
-
4% PFA 是常用固定液,能较好地保持 RNA 和形态结构。
-
固定时间过长会导致交联增强,降低探针通透性和杂交效率。
-
建议:组织块固定 4-12 小时,载玻片样品固定不超过 15 分钟。
-
-
甘氨酸:
-
可抑制蛋白酶 K 的作用,避免样品过度消化。
-