【科研绘图系列】R语言绘制论文组合图形(multiple plots)
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文章目录
- 介绍
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 画图1
- 画图2
- 画图3
- 画图4
- 画图5
- 系统信息
介绍
这篇文章详细介绍了如何使用R语言进行科研绘图,特别是绘制论文组合图形(multiple plots)。文章从数据的导入、预处理到图形的绘制,提供了一套完整的流程,帮助科研人员高效地完成数据可视化任务。
文章首先介绍了所需的数据可以通过百度网盘链接下载。数据文件包括不同平台和采集方法下的性能指标数据,如pAUC、nMCC、G-mean等。这些数据是后续绘图的基础。
在数据预处理阶段,作者使用了readxl
包来读取Excel文件,并对数据进行了排序和分组。例如,将数据按照平均排名进行排序,并根据排名将数据分为不同的区间(如top5%、5-25%等)。此外,还对数据进行了筛选,去除了某些指标值为零的行。
文章详细介绍了如何使用ggplot2
包绘制多种图形。例如:
- 图1:使用小提琴图展示了不同性能指标的分布情况。通过自定义颜色