26个脑影像工具包合集分享：从预处理到SCI成图

为方便各位脑科学研究者更好地使用优质的开源工具，本期脑海科技实验室汇总了近期整理的脑影像分析软件，希望可以帮助大家。

脑影像分析软件汇总

本次总结脑影像工具包合集（点击本条文字内容跳转）

工具包包括

1、CONN：用于计算、显示和分析fMRI中的功能连接工具包

2、SimTB：基于Matlab的fMRI数据仿真工具箱，支持自定义时空源、实验设计（块/事件相关）、头部运动模拟，提供GUI与脚本双模式，助力分析方法验证与算法开发。

3、CPCA：通过整合回归分析与主成分分析，精准分离任务态fMRI中刺激响应脑网络与基线活动，为神经机制研究提供高特异性建模工具。

4、JuSpace：基于Matlab的跨模态分析工具，整合MRI与多神经递质PET受体图谱

5、MOCA：基于Matlab的工作流程，用于设计新的和分析现有的 fNIRS 模块及其相关探针。

6、NBS-Predict：基于脑网络的机器学习预测工具包

7、BCT：基于MATLAB用于复杂网络分析和大脑连接数据集研究的工具包，它提供了一系列复杂网络方法。

8、PreSurgMapp：用于个体化术前映射的多模态功能磁共振成像（fMRI）处理流程工具包

9、rsHRF：用于静息态HRF解卷积和连接性分析的工具包

10、WFU PickAtlas：基于图谱的脑区ROI生成工具

11、AT-4-fMRI：用于单个体功能磁共振成像（fMRI）分析的工具包，旨在提高脑部功能区域映射的可靠性和准确性。

12、BRANT（BRAinNetome Toolkit）：全流程fMRI分析工具包，集成预处理、功能连接、网络分析与可视化，支持动态GUI自定义扩展与默认参数简化操作

13、Graph Theoretic General Linear Model：从数据预处理到图论属性的计算，再到统计建模和显著性测试。

14、PAGANI Toolkit：用于大脑网络大数据的并行图论分析工具包。

15、SUIT：Matlab工具箱，专门用于分析人类小脑的成像数据。

16、ART：用于自动和手动检测fMRI数据中全局均值和运动异常值的图形工具。

17、JIP fMRI Analysis Toolkit：主要针对啮齿动物和非人灵长类动物的功能性磁共振成像（fMRI）数据分析而开发。

18、SimpleROIBuilder：医学成像分析的工具包

19、BrainNetClass：基于MATLAB的开源跨平台工具箱，旨在促进脑功能网络构建和分类的研究。

20、RFT_FDR：用于处理和分析功能数据的强大工具。

21、AIDA：AIDAmri是一种新型的基于图谱的成像数据分析流程，用于处理小鼠大脑的结构和功能数据，包括解剖MRI、基于扩散张量成像（DTI）的纤维追踪以及基于静息态功能MRI（rs-fMRI）的功能连接分析。

22、Diffusion：扩散加权图像系列的后处理。

23、MIBCA：专用于多模态脑影像连接分析的软件

24、MICA：用于特定感兴趣区域的ICA

25、GraphVar：一个用户友好的MATLAB工具箱，用于对功能性大脑连接进行全面的图形分析。

26、ACTION：用于功能性MRI脑网络分析的增强和计算工具箱

为方便各位同仁使用，小编已找好所有工具包压缩包整理到百度网盘中。

以上26个工具包内容小编都已汇总到网盘中，每个工具包文件夹附文献说明+工具压缩包。

百度网盘资料预览：

工具包资料预览：