蛋白质数据库InterPro介绍
InterPro 是一个综合性的蛋白质家族、结构域和功能位点注释数据库,由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)维护。它的核心目标是通过整合多个蛋白质签名数据库,为蛋白质序列提供统一的注释,帮助研究人员识别蛋白质的功能、结构域、家族关系等。
网址: https://www.ebi.ac.uk/interpro/
InterPro 的主要特点
特点 | 描述 |
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数据库整合 | 将多个“签名”数据库(如 Pfam、SMART、TIGRFAMs、PANTHER 等)统一整合,提供标准化注释。 |
功能注释 | 提供蛋白质的功能信息、家族分类、结构域和功能位点等详细信息。 |
序列注释 | 对 UniProtKB 中的蛋白质序列进行注释,包括家族、结构域、重复序列和功能位点等。 |
InterPro Entries | 每个 InterPro 项目代表一种蛋白质家族、结构域或功能位点,整合了多个来源数据库的信息。 |
InterProScan 工具 | 提供本地或在线服务,可对任意蛋白质序列运行分析并获得注释结果。 |