【一览表】病理图像处理流程

目录：

1. WSI获取
   本专栏以TCGA数据库为例，详细介绍TCGA数据库中特定癌症数据集WSI的选择与下载，以及下载后如何将WSI的存放位置进行批量化整理（提供Python代码）。
2. 对WSI进行人工标注（可没有）
   以QuPath软件为例，介绍如何运用工具对WSI进行ROI圈画。并介绍标注文件的保存，标注文件的内容解读。
3. WSI预处理
   3.1 将WSI进行组织分割以及Patch剪裁
   本专栏将分别对无标注的WSI以及人工标注的WSI的Patch剪裁流程进行介绍，提供Python代码。
   3.2 染色归一化
   本专栏对staintools工具进行介绍，并提供批量化染色归一化的Python代码。
4. 特征提取
   有的模型是直接使用特征向量作为深度学习模型的输入，因此，本专栏对CLAM模型的特征提取方式进行介绍，提供linux指令。