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随着小麦基因组研究的不断深入,高质量的参考基因组(如T2T基因组)陆续发布,极大地推动了小麦基因功能解析与分子机制研究的发展。

目前,小麦“中国春”参考基因组已发布了多个版本(IWGSC CS 1.0-2.1),中国农业大学(CAU)和北京大学现代农业研究院(IAAS)等单位发布了更高质量的中国春参考基因组,为小麦遗传和育种研究提供了更准确的指导。

然而,不同版本基因组之间的基因ID命名规则和物理位置存在差异,导致研究人员在整合多组学数据时面临基因ID不统一、无法匹配的难题。

为解决这一问题,定制化开发了 Wheat Gene ID Convert Tool, 这是一个专为小麦研究者设计的在线基因ID批量转换工具,无需下载安装,使用浏览器即可交互式完成常用版本基因ID转换,方便用户快速开展研究工作。

本工具支持中国农业大学(CAU)版本与北京大学现代农业研究院(IAAS)版本、中国春IWGSC 01G版本、02G版本、03G版本之间的基因ID相互转换,帮助科研人员快速完成跨版本基因数据的对接与整合,同时提供转换前后的Excel表格形式输出文件,下载后如下图所示。

支持转换的基因ID格式

目前工具支持以下五种主流参考基因组版本的基因ID格式:

  • CSIAAS1AG0001400LC(IAAS)
  • TraesCSC1A01G009100(CAU)
  • TraesCS1B01G015000(01G)
  • TraesCS1A02G004400(02G)
  • TraesCS1A03G0013400(03G)

只需要提供以上任意一种格式的基因ID列表,即可在线转换为其他版本匹配的基因ID,提供便捷转换功能。

使用方法指南

使用本工具进行基因ID转换非常简单,只需三步即可完成:

✅ 第一步:准备基因ID列表

打开Excel或其他表格处理软件,将您需要转换的基因ID整理成一列,其中每行一个ID,注意不要空格或特殊符号,全选该列并复制。

✅ 第二步:粘贴并选择版本

访问在线工具网站,在输入框中粘贴复制的基因ID列表(支持纯文本或带换行的多行内容),然后在下拉菜单中选择原始基因ID版本和目标基因ID版本。

✅ 第三步:开始转换

点击【开始转换】按钮,系统将在段时间内完成批量匹配与转换,转换结果将直接显示在下方结果区域,然后下载结果为表格文件,便于后续分析使用。

工具优势

在线免安装,无需下载软件,打开网页即可使用。
批量高效,一次可转换数百至上千个基因ID。
结果可导出,支持文本和CSV格式下载。
建议收藏本网页以便长期使用。

https://filll.cn/WheatTools/GeneID

如有问题、建议或其他使用需求,欢迎联系开发者,
邮箱:admin@filll.cn

http://www.dtcms.com/a/606512.html

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